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科目A免除を合格して残りは科目Bだけになり勉強していってるんですが、プログラムというものに全く触れたことが全くなく、大滝本を使って基礎問題から、応用問題まで解いています。ですが、応用問題になってから全然解けなくて挫折しそうです。
科目Bの問題は、応用問題がたくさん出ると聞いたのでとても不安です。この掲示板の他の人のように５００点以上も取れません。
一日の勉強時間や勉強方法が知りたいです。

その書籍を持っていないので明確な答えは書けませんが一番重要なポイントは、なぜ答えられないのか？を分析することに尽きます。

恐らくですが問題文（文章）の意味が理解できず答えられない。
になっていると推測します。

もしこの問題であるならどんなに時間がかかってでも、問題文の意味を理解する。しか方法はありません。
※ここで言う問題文とは、擬似言語のことではありません。

推測では問題文が読み取れないにフォーカスして書きましたが、本当の意味はご自身がなぜ答えられないのかを分析する必要があります。
その分析によって、学習時間も学習方法も変わってくると思います。

自分もプログラムに全く触れたことがありませんでしたが、
配列を理解したうえでテキスト読んで過去問解いて解説動画観て…
を繰り返していたら２週間くらいで大体解けるようになりました。 
ITエンジニアの教室 という動画がとても参考になりました。
慣れればトレース無しで解ける（または選択肢を半分以下に絞り込める）ようになります。

６割取れればいい試験なので、本番で難問は後回しにしましょう。
基本的なアルゴリズム問題とセキュリティを最初に解き、あとは頑張れば解けそうな問題から
時間をかけて答えていけばきっと６割に届きます。

科目Bの勉強時間は休日５時間、平日１時間くらいやっていたのでトータルで４５時間くらいでした。

大滝本いいですが、プログラム苦手な人は出るとこだけ科目bのテキストからやった方がいいですよ。
その後に大滝本やるといいと思います。