https://www.jitec.ipa.go.jp/1_05goukaku/goukaku.html
こちらで公開されている令和3年度秋期試験合格者受験番号一覧の基本情報技術者試験（特別措置試験）何かしらの事情でCBT試験が受けられない人の合格番号って認識であってますか？

普通にCBTの試験で受けた人はプロメトリックのJPから始まる番号がそのまま合格発表に使われるって認識であってますか？

その認識で大丈夫です。

CBT試験を受けた方の合格発表はhttps://www.jitec.ipa.go.jp/1_11seido/cbt_sg_fe.htmlの「合格者受験番号一覧・合格発表日・合格証書発送日・官報公示日」以下ページで行われます。