メールのスコアでは合格に達しているのですか、選択問題の選択ミスしている場合不合格になることはあるのですか？また、その選択問題の選択ミスに関して、試験センターに正しく採点してもらえるように出来ますか？

選択問題のチェックを未選択で不合格の報告がありますので、その場合も選択問題の得点が足りない場合は不合格になります。

選択問題を余分に回答せず必須の選択チェック忘れならともかく、
選択ミスについてはセンター側ではそれを判断すことができませんので採点のやりなおしもありません。

それを可能にしてしまうと
例えば問2,3と問7を回答、それ以外の問4,5,8～11は適当に埋めておく。
スコアレポートを見た後、回答した問2,3と問7があまりいい点ではなく、適当に埋めた問4と問9が9割以上正解していたのがわかったので問2,3のできの悪い方を問4と交換、問7と問9を交換して合格点に達するということが起こりえます。

今回テストを受けて思ったことは
テスト終了時に選択チェックが未選択状態だったらそれがわかるようなエラーメッセージをつけてほしいなと思った。(未回答がありますじゃなく)。
選択外の選択問題の回答欄について無駄に必須チェックをつけるよりかこっちのほうが重要だろ。

たしかにそーですよね。お返事ありがとうございます。

冒頭にしっかり注意書きが表示されているので選択チェックも試験のうちです。
これをミスると門前払いと考えるべき。
数にしても圧倒的少数派なのでこれについてIPAが対処するとは思えないですね。